Ook al heet het de 'boekhoud-module', dit onderdeel is helemaal 'verweven' in Cosmeticienne. Hierdoor wordt verkoop welke u in het basispakket (bij de klanten) invoert automatisch in de boekhouding verwerkt. Datzelfde geldt voor orders die u via het voorraadbeheer (bestellingen) afwerkt.
De boekhoudmodule zelf is een duidelijk overzichtelijk geheel. Standaard worden enkel de dagboeken (o.a. kas, bank, debiteuren en crediteuren) getoond. Uiteraard kunt u zelf grootboekrekeningen toevoegen en wijzigen. Wijzigingen kunnen achteraf worden gemaakt en ieder jaar is een administratie op zichzelf. Van ieder overzicht kunt u een uitdraai maken (of exporteren naar programma's als MS Excel of MS Word) en heeft u de beschikking op de kant-en-klare rapporten als een BTW-aangifte, grootboekkaartjes, balans of een boekingsverslag.